Protein–RNA interactions for Protein: Q61550

Rad21, Double-strand-break repair protein rad21 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 635 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad21Q61550 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Ikzf1-203ENSMUST00000065433 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Rad21Q61550 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Glra1-201ENSMUST00000075603 2037 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Sh3bp1-201ENSMUST00000001226 2510 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Acss2-202ENSMUST00000065973 2876 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Col27a1-201ENSMUST00000036300 7612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Rad21Q61550 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Rad21Q61550 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.6 ms