Protein–RNA interactions for Protein: Q60976

Jrk, Jerky protein, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
JrkQ60976 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Mvb12a-201ENSMUST00000034272 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Lad1-201ENSMUST00000038760 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
JrkQ60976 C030014I23Rik-201ENSMUST00000080911 1810 ntBASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Smarca4-202ENSMUST00000098948 6376 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Wasf1-202ENSMUST00000105509 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Stard10-211ENSMUST00000210192 1258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.93■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Insig2-203ENSMUST00000159085 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Rsu1-209ENSMUST00000191959 720 ntTSL 3 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Crabp1-201ENSMUST00000034830 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Flywch2-201ENSMUST00000024704 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Anapc7-203ENSMUST00000122010 2950 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Hebp2-201ENSMUST00000020000 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Pgap3-205ENSMUST00000128897 1264 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Creb1-203ENSMUST00000171164 1287 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm10252-201ENSMUST00000209541 832 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
JrkQ60976 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.8 ms