Protein–RNA interactions for Protein: Q60765

Atf3, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-3, mousemouse

Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf3Q60765 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Srrd-201ENSMUST00000031289 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Slbp-202ENSMUST00000075670 1027 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 B3gat2-203ENSMUST00000144602 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Wdr55-201ENSMUST00000049323 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Fhl3-201ENSMUST00000038684 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Zc3h15-201ENSMUST00000081591 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Btf3-204ENSMUST00000134542 780 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Lce3b-201ENSMUST00000046234 562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Atf3Q60765 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm15467-201ENSMUST00000120582 445 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 AV026068-207ENSMUST00000187718 400 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 CT943659.1-201ENSMUST00000215459 326 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Lmo4-207ENSMUST00000196264 1263 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Higd1b-201ENSMUST00000021302 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm15165-201ENSMUST00000118140 502 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 1190007I07Rik-203ENSMUST00000183363 406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Anapc15-202ENSMUST00000035395 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 1190007I07Rik-201ENSMUST00000079648 716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Golph3-205ENSMUST00000228671 2842 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Mgat2-201ENSMUST00000060579 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Coq5-201ENSMUST00000040421 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Rcc1-202ENSMUST00000084250 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Noxa1-201ENSMUST00000044018 1617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Qrich1-206ENSMUST00000193258 2291 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 1700039E22Rik-201ENSMUST00000174082 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Xk-201ENSMUST00000015486 5076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Npcd-202ENSMUST00000089299 1453 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Adamts18-201ENSMUST00000093113 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Rnf121-202ENSMUST00000096639 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Rnf146-203ENSMUST00000160372 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm32996-201ENSMUST00000199828 1447 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Gm45890-204ENSMUST00000212356 545 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Pecr-202ENSMUST00000097698 932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Atf3Q60765 Olfr632-201ENSMUST00000098189 954 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms