Protein–RNA interactions for Protein: Q60677

Itgae, Integrin alpha-E, mousemouse

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ItgaeQ60677 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Pi4k2b-201ENSMUST00000031081 3139 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Tsfm-202ENSMUST00000120547 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 1810012K08Rik-201ENSMUST00000155199 574 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Mir8112-201ENSMUST00000184382 131 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Vkorc1l1-203ENSMUST00000201855 4809 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Baiap2-202ENSMUST00000075180 3518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Sprtn-201ENSMUST00000034467 4464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Gm10461-201ENSMUST00000202073 4786 ntBASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Tmf1-201ENSMUST00000095664 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.77■□□□□ 0.6
ItgaeQ60677 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC18.77■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
ItgaeQ60677 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms