Protein–RNA interactions for Protein: Q5U4D8

Slc5a6, Sodium-dependent multivitamin transporter, mousemouse

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a6Q5U4D8 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Gm8909-202ENSMUST00000097335 1182 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Large1-204ENSMUST00000212459 4746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ing1-207ENSMUST00000211007 2241 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Rbbp7-202ENSMUST00000112326 1430 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ell2-201ENSMUST00000001583 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Chic2-201ENSMUST00000075452 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Atp5c1-203ENSMUST00000114897 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Brpf1-202ENSMUST00000113119 4826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Adgrl1-205ENSMUST00000132500 5719 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Gm14321-201ENSMUST00000127441 632 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Purg-201ENSMUST00000070340 1064 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Igf2-205ENSMUST00000121128 4722 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Slc5a6Q5U4D8 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Ube2a-208ENSMUST00000202812 719 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Slc5a6Q5U4D8 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms