Protein–RNA interactions for Protein: Q5RJB0

Bhlha9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, mousemouse

Predictions only

Length 231 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlha9Q5RJB0 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Aatk-203ENSMUST00000103020 5687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ets1-201ENSMUST00000034534 5080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Gm45822-201ENSMUST00000212231 259 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Naxe-201ENSMUST00000029708 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Anapc7-201ENSMUST00000031422 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Tmem80-206ENSMUST00000133012 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 AC061963.1-203ENSMUST00000213473 453 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 4930518J20Rik-201ENSMUST00000195064 1478 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
Bhlha9Q5RJB0 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Sqstm1-205ENSMUST00000143379 1266 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Mef2d-203ENSMUST00000107559 1791 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Vstm5-201ENSMUST00000034413 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Cracr2b-207ENSMUST00000170879 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Gabra5-202ENSMUST00000206382 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Kctd1-202ENSMUST00000168989 3456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Pou2f2-201ENSMUST00000098679 2340 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Rhot1-201ENSMUST00000017831 3029 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Bhlha9Q5RJB0 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.1 ms