Protein–RNA interactions for Protein: Q5NCF2

Trappc1, Trafficking protein particle complex subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trappc1Q5NCF2 Aire-203ENSMUST00000105396 1749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Aire-214ENSMUST00000154374 1712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Aire-215ENSMUST00000155021 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Rxrb-203ENSMUST00000173354 1743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Zfp553-201ENSMUST00000056232 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Sphk1-206ENSMUST00000106388 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Dnajb11-205ENSMUST00000178320 1628 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Aifm2-204ENSMUST00000105455 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nell1-201ENSMUST00000081872 6617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 4930519P11Rik-201ENSMUST00000181369 501 ntAPPRIS P1 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Nadk-203ENSMUST00000105613 3152 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Dxo-211ENSMUST00000180043 1447 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Cd37-209ENSMUST00000211373 1428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 St6galnac2-201ENSMUST00000079545 3643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Rnf139-201ENSMUST00000036904 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Tmcc3-201ENSMUST00000065060 5530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Ubald2-201ENSMUST00000057676 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 A330074K22Rik-201ENSMUST00000183235 2489 ntTSL 1 (best) BASIC12.59□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Wipf3-204ENSMUST00000132855 4516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.39
Trappc1Q5NCF2 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Agbl3-204ENSMUST00000115016 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tmem201-201ENSMUST00000054459 4631 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tbc1d1-203ENSMUST00000119756 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Kirrel-202ENSMUST00000107618 7278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Bex1-201ENSMUST00000058125 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Med15-202ENSMUST00000080936 3263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Axin1-202ENSMUST00000118904 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Hoxd4-202ENSMUST00000111980 1494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Dmpk-202ENSMUST00000108473 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Xpo6-201ENSMUST00000009344 4455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Nrxn1-209ENSMUST00000161402 4953 ntTSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Foxp1-225ENSMUST00000177229 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.58□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Crybg1-201ENSMUST00000020017 6608 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tcf7-202ENSMUST00000109071 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Chgb-201ENSMUST00000028826 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 1700016H13Rik-203ENSMUST00000120108 797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ugcg-201ENSMUST00000030074 4012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ccdc84-202ENSMUST00000213813 2675 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 1700052K11Rik-201ENSMUST00000190120 3708 ntBASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Prkag2-203ENSMUST00000114975 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rlf-201ENSMUST00000056635 6242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Chst10-205ENSMUST00000193441 4999 ntTSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.57□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gemin5-202ENSMUST00000102711 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Kctd13-201ENSMUST00000032924 1676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Pi4kb-202ENSMUST00000107251 2895 ntTSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ddhd1-202ENSMUST00000087320 9820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Trappc1Q5NCF2 Ttl-201ENSMUST00000035812 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.56□□□□□ -0.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.7 ms