Protein–RNA interactions for Protein: Q5NC05

Ttf2, Transcription termination factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,138 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttf2Q5NC05 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Dnm2-204ENSMUST00000165766 3063 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Wbp1-202ENSMUST00000113936 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ctdsp2-202ENSMUST00000105256 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Vamp4-203ENSMUST00000132158 2752 ntTSL 3 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Mal-202ENSMUST00000028854 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tspan4-201ENSMUST00000026585 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gnao1-207ENSMUST00000138659 5526 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Atxn7l2-204ENSMUST00000119650 2274 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Cobll1-205ENSMUST00000112431 5024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Arntl-203ENSMUST00000210074 2554 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Nsmf-201ENSMUST00000006646 2922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm43272-201ENSMUST00000200599 1584 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tpm1-204ENSMUST00000113684 887 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Cmc1-201ENSMUST00000044220 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Trim7-201ENSMUST00000046903 2161 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tmem151b-201ENSMUST00000180252 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gata6-201ENSMUST00000047762 3194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Ttf2Q5NC05 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.9 ms