Protein–RNA interactions for Protein: Q5DTT3

Fam208b, Protein FAM208B, mousemouse

Predictions only

Length 2,382 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam208bQ5DTT3 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Ptpdc1-201ENSMUST00000035824 4402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Nsmf-206ENSMUST00000114388 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Plk3-201ENSMUST00000076859 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Smim4-204ENSMUST00000203261 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Dynll2-204ENSMUST00000178105 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Agpat3-201ENSMUST00000001240 5980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Cldn7-201ENSMUST00000018713 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Dynll2-202ENSMUST00000107923 2443 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 AC154855.1-201ENSMUST00000227353 1458 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 B3gnt9-201ENSMUST00000093217 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 1700025J12Rik-201ENSMUST00000205586 630 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Ephb4-203ENSMUST00000111055 4296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Phf23-204ENSMUST00000133485 1607 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 S1pr4-201ENSMUST00000053646 2386 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Prss45-202ENSMUST00000146794 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Auh-203ENSMUST00000119311 2627 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Neurl1a-202ENSMUST00000111808 4157 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Gm7856-201ENSMUST00000117514 1493 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 A230065H16Rik-201ENSMUST00000150384 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Erdr1-203ENSMUST00000179077 887 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Fam208bQ5DTT3 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms