Protein–RNA interactions for Protein: Q59J78

Ndufaf2, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex assembly factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf2Q59J78 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 1700030C12Rik-201ENSMUST00000101462 858 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Rpusd3-202ENSMUST00000113092 1269 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Nrn1l-201ENSMUST00000060167 617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 C1qtnf12-201ENSMUST00000024338 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Fdx1l-201ENSMUST00000010348 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Tmem203-201ENSMUST00000104998 854 ntAPPRIS P1 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm13148-201ENSMUST00000118892 745 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm12933-201ENSMUST00000120203 872 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ppt2-204ENSMUST00000168391 1342 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Pld2-201ENSMUST00000018429 3659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Fxyd1-215ENSMUST00000206474 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Hoxb6-201ENSMUST00000000704 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Mir5133-201ENSMUST00000174955 77 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Gm10153-202ENSMUST00000210290 963 ntAPPRIS P1 BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 AC164629.5-201ENSMUST00000220387 632 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Zfp367-202ENSMUST00000117241 2753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ipo9-201ENSMUST00000041023 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.45
Ndufaf2Q59J78 Ube2b-202ENSMUST00000109086 585 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Hsp25-ps1-201ENSMUST00000109187 630 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Rab3c-203ENSMUST00000224180 967 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tceanc2-201ENSMUST00000030362 935 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm42918-201ENSMUST00000199249 1580 ntBASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Clta-201ENSMUST00000107845 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm15847-201ENSMUST00000121417 1065 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm16141-201ENSMUST00000152073 790 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Krtcap3-205ENSMUST00000201625 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm26571-205ENSMUST00000223215 591 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Sphk1-202ENSMUST00000063446 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ddx39b-201ENSMUST00000068056 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Aqp1-201ENSMUST00000004774 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Boll-203ENSMUST00000159398 658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 2310068J16Rik-201ENSMUST00000188271 1124 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Gm19391-201ENSMUST00000196653 999 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Cetn3-201ENSMUST00000022009 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Pdk3-201ENSMUST00000045748 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Ndufaf2Q59J78 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.7 ms