Protein–RNA interactions for Protein: Q52KR2

Lrig2, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,054 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrig2Q52KR2 Ilk-212ENSMUST00000163389 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm36736-201ENSMUST00000206060 646 ntTSL 3 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Thap3-201ENSMUST00000036680 1124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Park7-201ENSMUST00000030805 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Dusp15-201ENSMUST00000037715 715 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Arrb1-210ENSMUST00000179755 7135 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Arrb1-202ENSMUST00000098266 7132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Zfp622-201ENSMUST00000061875 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ppp2ca-201ENSMUST00000020608 7102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Ttc14-203ENSMUST00000117915 4913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Gm4974-201ENSMUST00000209974 875 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Lrig2Q52KR2 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Lrig2Q52KR2 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.6 ms