Protein–RNA interactions for Protein: Q4V9W2

Srek1ip1, Protein SREK1IP1, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srek1ip1Q4V9W2 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Khdc3-201ENSMUST00000034737 1681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Slc36a4-202ENSMUST00000115588 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tox2-201ENSMUST00000099110 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Col5a1-201ENSMUST00000028280 8406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Asph-210ENSMUST00000108337 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Mark2-209ENSMUST00000165965 2874 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ttll3-201ENSMUST00000032414 3168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Cacna2d2-202ENSMUST00000085092 5183 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Errfi1-201ENSMUST00000030811 3043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Rab37-202ENSMUST00000067754 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gm42911-201ENSMUST00000199360 1630 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tex30-212ENSMUST00000152239 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Arl4c-202ENSMUST00000159814 3997 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Slc35d2-201ENSMUST00000099441 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Pfkfb4-203ENSMUST00000198140 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Atp2b3-203ENSMUST00000114479 4637 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 A930012O16Rik-202ENSMUST00000156418 1541 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ccne2-207ENSMUST00000170901 3006 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gm19430-201ENSMUST00000193847 2137 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Fam49b-207ENSMUST00000228226 1896 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Epb41l1-202ENSMUST00000103135 6177 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Acot7-201ENSMUST00000030779 1425 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Grhl2-203ENSMUST00000161405 1996 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ptprs-202ENSMUST00000086828 5608 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Patz1-205ENSMUST00000110043 3702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Sybu-209ENSMUST00000228639 4113 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Msi1-208ENSMUST00000150779 3133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Lsm6-201ENSMUST00000051867 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Col7a1-202ENSMUST00000112070 9250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Etnk1-203ENSMUST00000204947 1791 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Kcnip1-201ENSMUST00000065970 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Srek1ip1Q4V9W2 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Hsdl2-201ENSMUST00000030078 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Shroom3-202ENSMUST00000113054 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gk-201ENSMUST00000026039 4340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Gm37374-201ENSMUST00000194954 1829 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Wrb-201ENSMUST00000023913 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Srek1ip1Q4V9W2 Kif7-203ENSMUST00000183846 4577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms