Protein–RNA interactions for Protein: Q4FZC9

Syne3, Nesprin-3, mousemouse

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syne3Q4FZC9 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Ptp4a2-201ENSMUST00000030578 3646 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Syne3Q4FZC9 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Psmd4-202ENSMUST00000107237 1332 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Vps51-209ENSMUST00000160590 840 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Snx27-201ENSMUST00000029783 6261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Plppr4-201ENSMUST00000061071 5696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tead3-205ENSMUST00000154873 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Hrh3-202ENSMUST00000163215 1401 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 1110046J04Rik-201ENSMUST00000147622 397 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Rps2-ps3-201ENSMUST00000213102 832 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Krt86-201ENSMUST00000088049 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Clk4-201ENSMUST00000093132 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Myo5b-201ENSMUST00000074157 6745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Syne3Q4FZC9 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms