Protein–RNA interactions for Protein: Q3V2J1

6430531B16Rik, RIKEN cDNA 6430531B16 gene, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
6430531B16RikQ3V2J1 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Artn-202ENSMUST00000097913 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Atp2a2-201ENSMUST00000031423 4486 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Pcdh1-203ENSMUST00000160721 5416 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Ttc6-203ENSMUST00000172939 5782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Adcy5-201ENSMUST00000114913 7007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Trim24-201ENSMUST00000031859 4042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
6430531B16RikQ3V2J1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Tmed4-201ENSMUST00000004508 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Mgll-205ENSMUST00000150180 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 2610035F20Rik-202ENSMUST00000177306 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm3331-201ENSMUST00000183423 1017 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 4933406B15Rik-201ENSMUST00000220065 1182 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Hist1h2ap-201ENSMUST00000081342 482 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Shank1-202ENSMUST00000107935 6649 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Ythdc1-203ENSMUST00000120498 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Trhde-201ENSMUST00000061632 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Nedd4l-202ENSMUST00000163516 8163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Agfg2-201ENSMUST00000031736 2893 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Aftph-201ENSMUST00000035350 3998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Snx15-201ENSMUST00000025702 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Fam98c-203ENSMUST00000134176 1189 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Galnt13-202ENSMUST00000112634 7639 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Rnf168-203ENSMUST00000171474 4460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Dlgap1-206ENSMUST00000133717 2355 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Apaf1-208ENSMUST00000162618 5151 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Dsg2-201ENSMUST00000059787 5766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Appl1-201ENSMUST00000036570 7642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
6430531B16RikQ3V2J1 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.5 ms