Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0L5

Lrrc43, Leucine-rich repeat-containing protein 43, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrrc43Q3V0L5 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Mrpl15-203ENSMUST00000130201 1894 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 9130024F11Rik-201ENSMUST00000135238 1300 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Galnt3-201ENSMUST00000028378 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm3468-201ENSMUST00000165193 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm2956-201ENSMUST00000177786 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Smim10l2a-201ENSMUST00000068106 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Lrrc43Q3V0L5 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Rap1b-201ENSMUST00000064667 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 AI115009-201ENSMUST00000181093 1853 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Tmem263-201ENSMUST00000095383 3616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Ndufaf3-201ENSMUST00000074208 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
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Lrrc43Q3V0L5 Tril-201ENSMUST00000127748 5363 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Spry1-202ENSMUST00000108107 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Lrrc43Q3V0L5 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Lrrc43Q3V0L5 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
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Lrrc43Q3V0L5 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Lrrc43Q3V0L5 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Lrrc43Q3V0L5 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Dact2-201ENSMUST00000053218 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
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Lrrc43Q3V0L5 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Lrrc43Q3V0L5 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.7 ms