Protein–RNA interactions for Protein: Q3V0J4

Ankrd53, Ankyrin repeat domain-containing protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 497 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ankrd53Q3V0J4 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Zar1-201ENSMUST00000073528 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 A130048G24Rik-201ENSMUST00000193052 2750 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ttpal-202ENSMUST00000109408 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Comtd1-204ENSMUST00000177527 714 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Iqsec2-203ENSMUST00000112605 6017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Nsg1-204ENSMUST00000201363 820 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gpr84-201ENSMUST00000079824 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm8668-201ENSMUST00000120559 1447 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Dnajb3-201ENSMUST00000119972 1051 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm17182-201ENSMUST00000163795 860 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Bcs1l-202ENSMUST00000113732 1679 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Iqgap2-201ENSMUST00000068603 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 D1Ertd622e-204ENSMUST00000153115 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm11973-203ENSMUST00000155498 867 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Zfpl1-201ENSMUST00000025707 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Ankrd53Q3V0J4 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.2 ms