Protein–RNA interactions for Protein: Q3UYG1

Ccdc160, Coiled-coil domain-containing protein 160, mousemouse

Predictions only

Length 323 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc160Q3UYG1 Pycr2-201ENSMUST00000027802 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Rab22a-201ENSMUST00000029024 7155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Chrm3-202ENSMUST00000187510 4336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm37563-201ENSMUST00000192580 1513 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Cadps2-204ENSMUST00000115356 3533 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tle1-203ENSMUST00000074216 4369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tef-201ENSMUST00000023024 4079 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Pgm2l1-202ENSMUST00000084935 8834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Shpk-201ENSMUST00000006105 2808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
Ccdc160Q3UYG1 Gm16011-201ENSMUST00000121567 2662 ntBASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rhno1-203ENSMUST00000112152 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Bmp8b-201ENSMUST00000002457 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Tle3-205ENSMUST00000159630 4065 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 AC133083.1-201ENSMUST00000221736 2209 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Hoxc12-201ENSMUST00000055562 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Esx1-201ENSMUST00000074698 1600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Notch3-201ENSMUST00000087723 8044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rassf1-201ENSMUST00000010211 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Adamts17-201ENSMUST00000098382 6025 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 G3bp2-204ENSMUST00000169094 2716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Cspg5-201ENSMUST00000035058 3870 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Dlc1-203ENSMUST00000098826 6241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Zfp382-201ENSMUST00000098596 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Gm12660-201ENSMUST00000123764 664 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Runx2-213ENSMUST00000162878 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Sptlc2-201ENSMUST00000021424 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Akp3-201ENSMUST00000044878 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Kpna4-203ENSMUST00000194558 3726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Vstm2b-203ENSMUST00000205845 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Saysd1-201ENSMUST00000059666 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rffl-206ENSMUST00000108173 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Fbxl16-201ENSMUST00000045692 3478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rab23-201ENSMUST00000088287 4322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 BC037032-204ENSMUST00000155191 3291 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Ctsd-202ENSMUST00000151120 2127 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Ankrd23-201ENSMUST00000054665 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Tcp11-203ENSMUST00000114836 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Slc6a1-204ENSMUST00000204074 1740 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Ptprs-211ENSMUST00000223859 5588 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Ccdc160Q3UYG1 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms