Protein–RNA interactions for Protein: Q3UWQ3

Ube2fb, NEDD8-conjugating enzyme UBE2F-B, mousemouse

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ube2fbQ3UWQ3 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Ube2fbQ3UWQ3 Krcc1-203ENSMUST00000204436 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2fbQ3UWQ3 Bcat2-201ENSMUST00000033098 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2fbQ3UWQ3 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2fbQ3UWQ3 Chtop-203ENSMUST00000076639 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.17
Ube2fbQ3UWQ3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Naa50-202ENSMUST00000063542 2136 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 P2rx4-202ENSMUST00000081554 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Polr2m-202ENSMUST00000163972 2138 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Sobp-201ENSMUST00000040275 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 4930447C04Rik-201ENSMUST00000044000 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gpr137b-ps-203ENSMUST00000220758 1942 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm10654-201ENSMUST00000098653 1633 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Dbndd2-204ENSMUST00000109350 1055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ebf3-204ENSMUST00000169486 4994 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Keap1-204ENSMUST00000193982 2163 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Fgf22-202ENSMUST00000219228 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Large1-202ENSMUST00000119826 4647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Tymp-201ENSMUST00000023285 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Slc25a26-201ENSMUST00000061118 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Grip1-201ENSMUST00000041962 5343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Cbx1-201ENSMUST00000018810 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Espn-209ENSMUST00000105655 1350 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Gm4316-202ENSMUST00000212490 1115 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Ube2fbQ3UWQ3 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms