Protein–RNA interactions for Protein: Q3UU41

Scimp, SLP adapter and CSK-interacting membrane protein, mousemouse

Predictions only

Length 150 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScimpQ3UU41 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
ScimpQ3UU41 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Fam241b-209ENSMUST00000142821 1283 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Gm44549-201ENSMUST00000208351 577 ntBASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Arl10-201ENSMUST00000026988 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Slc7a6os-201ENSMUST00000035925 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Lrrn2-201ENSMUST00000027706 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Lhfpl4-201ENSMUST00000162280 4762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Arhgap39-202ENSMUST00000077821 4494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Mrpl9-202ENSMUST00000196143 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Ormdl3-201ENSMUST00000052919 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Lrig3-201ENSMUST00000074807 4016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Dgkz-202ENSMUST00000099709 3512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Ttc32-202ENSMUST00000219470 1645 ntTSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Usp47-201ENSMUST00000106653 5540 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Rpl27-202ENSMUST00000107249 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Simc1-201ENSMUST00000118072 2116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Gm7075-201ENSMUST00000054760 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Hist2h2aa2-201ENSMUST00000074976 528 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Hist2h2aa1-201ENSMUST00000078756 586 ntAPPRIS P1 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Igdcc3-201ENSMUST00000034961 3146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Flg-201ENSMUST00000050758 1488 ntBASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Arrb2-202ENSMUST00000084954 1732 ntTSL 5 BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Car2-201ENSMUST00000029078 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Pacsin3-201ENSMUST00000028694 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.06■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Susd1-201ENSMUST00000040166 3295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Fam219b-202ENSMUST00000114200 3017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ScimpQ3UU41 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Atraid-201ENSMUST00000013766 966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Pole4-204ENSMUST00000160281 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Gm37564-201ENSMUST00000195000 330 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Mtag2-201ENSMUST00000058665 714 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Klhl31-201ENSMUST00000057781 6494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Espn-206ENSMUST00000103196 1323 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Fam3c-203ENSMUST00000163963 1617 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Cep135-202ENSMUST00000121979 5537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Cd5-201ENSMUST00000025571 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Plekha4-202ENSMUST00000209517 2577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Epm2a-201ENSMUST00000069106 3287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Aaed1-202ENSMUST00000220895 2858 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Gpx4-202ENSMUST00000105372 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Tecr-203ENSMUST00000165740 1120 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ScimpQ3UU41 Gm42555-201ENSMUST00000199304 1039 ntBASIC15.04■□□□□ -0
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.8 ms