Protein–RNA interactions for Protein: Q3UT53

BB287469, Expressed sequence BB287469, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BB287469Q3UT53 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 5330438I03Rik-201ENSMUST00000168347 2845 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Smim14-202ENSMUST00000121661 1056 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cacna2d2-203ENSMUST00000164988 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm21814-202ENSMUST00000203277 873 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Odf3b-204ENSMUST00000227834 930 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Usf3-201ENSMUST00000088356 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Capn1-202ENSMUST00000164843 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Pitpnm1-201ENSMUST00000049658 4206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Prdm6-203ENSMUST00000115399 2227 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Klf13-202ENSMUST00000183817 599 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Fam199x-201ENSMUST00000047852 8299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Arhgef7-205ENSMUST00000110909 4926 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
BB287469Q3UT53 Meox1-201ENSMUST00000057054 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 AC153881.2-201ENSMUST00000214877 204 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Galnt13-204ENSMUST00000112636 7530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Ankrd9-202ENSMUST00000128353 2577 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Ralgapa1-202ENSMUST00000110687 7874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Ndufa12-201ENSMUST00000020209 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
BB287469Q3UT53 Ldlrad4-201ENSMUST00000063775 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms