Protein–RNA interactions for Protein: Q3URY0

Rtl4, Retrotransposon Gag-like protein 4, mousemouse

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Length 304 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtl4Q3URY0 Rbks-201ENSMUST00000031018 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Xiap-203ENSMUST00000115094 6542 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Pou3f2-201ENSMUST00000178174 5587 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Scube2-202ENSMUST00000106728 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Ltbp1-201ENSMUST00000001927 6671 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Eral1-201ENSMUST00000021183 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Selenom-201ENSMUST00000094469 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Gpn2-201ENSMUST00000030661 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Baz1b-201ENSMUST00000002825 6492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Gm40460-201ENSMUST00000211591 735 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 AC175538.2-202ENSMUST00000224997 1057 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 Nat8-201ENSMUST00000032073 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Rtl4Q3URY0 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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Rtl4Q3URY0 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Rtl4Q3URY0 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
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