Protein–RNA interactions for Protein: Q3URK1

Ccdc190, Coiled-coil domain-containing protein 190, mousemouse

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc190Q3URK1 Gm45447-201ENSMUST00000209874 1805 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Sqor-201ENSMUST00000005953 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Lca5l-202ENSMUST00000113804 3162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Trmt2a-203ENSMUST00000115640 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Arrb2-204ENSMUST00000102564 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Fkbp11-201ENSMUST00000003445 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Sds-201ENSMUST00000066540 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Hist1h2ao-201ENSMUST00000091745 480 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Ikbke-204ENSMUST00000161764 2867 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Wnt2b-201ENSMUST00000029429 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Coch-202ENSMUST00000164782 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gpr137-201ENSMUST00000025909 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Bloc1s3-201ENSMUST00000077408 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Nat9-201ENSMUST00000103038 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Rex1bd-206ENSMUST00000136913 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Dpyd-204ENSMUST00000149101 531 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tmbim6-202ENSMUST00000159209 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Gm26571-201ENSMUST00000181399 666 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tmem183a-201ENSMUST00000049470 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Kbtbd11-201ENSMUST00000069399 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Tpm2-202ENSMUST00000107913 2098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Ccdc190Q3URK1 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Dnajb5-201ENSMUST00000037872 3291 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Ier2-201ENSMUST00000060427 1522 ntAPPRIS P1 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Ptbp3-204ENSMUST00000140925 606 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 March2-201ENSMUST00000066121 3400 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Osbpl1a-206ENSMUST00000121774 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Sox1ot-201ENSMUST00000080795 5064 ntTSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Golga7-202ENSMUST00000121783 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Pde8b-214ENSMUST00000172104 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Cd151-203ENSMUST00000177840 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Prelid3a-201ENSMUST00000025411 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Cnppd1-208ENSMUST00000190679 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Nfkbie-201ENSMUST00000024742 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Fbxl21-203ENSMUST00000121871 1963 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Syde1-201ENSMUST00000040580 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Ubald1-201ENSMUST00000037843 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Ppt1-201ENSMUST00000030412 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Trim28-201ENSMUST00000005705 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Fdxr-201ENSMUST00000021078 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 App-202ENSMUST00000226232 3120 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Gm22325-201ENSMUST00000158904 308 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Map1lc3b-203ENSMUST00000181521 775 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Nudt14-201ENSMUST00000002881 734 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Tmem53-201ENSMUST00000062824 991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Npepl1-201ENSMUST00000044415 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Ccdc190Q3URK1 Lrrtm1-203ENSMUST00000161677 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms