Protein–RNA interactions for Protein: Q3UPR8

D13Ertd608e, D13Ertd608e protein, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
D13Ertd608eQ3UPR8 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhps-201ENSMUST00000078665 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Nrm-201ENSMUST00000074259 1466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Intu-201ENSMUST00000061590 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Sox14-201ENSMUST00000054819 2065 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ctu1-201ENSMUST00000038332 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dhfr-201ENSMUST00000022218 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ankrd50-202ENSMUST00000120875 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pde5a-204ENSMUST00000200389 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pcyt2-203ENSMUST00000106188 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm29394-202ENSMUST00000176935 1326 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gamt-201ENSMUST00000020359 979 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Nt5c-201ENSMUST00000021082 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ckm-201ENSMUST00000003643 1235 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Diaph2-201ENSMUST00000037854 3742 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Vkorc1l1-202ENSMUST00000073945 650 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ptpro-203ENSMUST00000167679 5096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Col18a1-202ENSMUST00000081654 5063 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Celf1-201ENSMUST00000005643 4830 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Klf9-201ENSMUST00000036884 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cbx8-201ENSMUST00000026663 3580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Elf2-201ENSMUST00000062009 3353 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cfap206-202ENSMUST00000108136 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Stau2-203ENSMUST00000115359 1151 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Nfu1-202ENSMUST00000117583 950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 P4hb-203ENSMUST00000168360 770 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc11a1-201ENSMUST00000027368 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Arf1-202ENSMUST00000163300 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Slc9a6-202ENSMUST00000114784 4449 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Luc7l2-208ENSMUST00000161538 4253 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mms22l-205ENSMUST00000138567 1350 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm13790-201ENSMUST00000156209 473 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Pprc1-203ENSMUST00000111899 5246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Acy3-201ENSMUST00000054030 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Afg1l-201ENSMUST00000041024 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Rcc2-202ENSMUST00000071169 3999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Dtx2-204ENSMUST00000111145 2493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Epdr1-204ENSMUST00000221014 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Camk2d-226ENSMUST00000199300 5524 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Zfp142-201ENSMUST00000027315 6480 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
D13Ertd608eQ3UPR8 Mpst-201ENSMUST00000043865 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23 ms