Protein–RNA interactions for Protein: Q3ULW6

Ccdc33, Coiled-coil domain-containing protein 33, mousemouse

Predictions only

Length 985 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc33Q3ULW6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm24589-201ENSMUST00000116692 94 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Acss2-201ENSMUST00000029135 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Sbspon-201ENSMUST00000040695 2748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Gm11747-201ENSMUST00000142751 1648 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Pno1-201ENSMUST00000020317 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Slc29a1-201ENSMUST00000051574 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Smap1-201ENSMUST00000027339 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Tgif1-209ENSMUST00000166395 1714 ntTSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Olfr94-203ENSMUST00000222190 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Trim72-202ENSMUST00000106248 2134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Zbtb7c-202ENSMUST00000167921 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Ccdc33Q3ULW6 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Zfp579-206ENSMUST00000162731 2489 ntAPPRIS P1 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm11950-201ENSMUST00000121615 838 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm25925-201ENSMUST00000158314 306 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Spem1-201ENSMUST00000045771 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Tlcd1-201ENSMUST00000092880 2700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Fezf1-201ENSMUST00000031709 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Srsf11-202ENSMUST00000072875 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 4930560O18Rik-201ENSMUST00000207051 1595 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm42922-201ENSMUST00000195887 2078 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gpsm3-201ENSMUST00000038244 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm20604-201ENSMUST00000174651 2795 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Krt87-201ENSMUST00000081945 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Sae1-204ENSMUST00000211741 1663 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Rpl36al-201ENSMUST00000054544 526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Dbr1-201ENSMUST00000066650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Lyl1-201ENSMUST00000037165 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Sstr1-202ENSMUST00000110671 1752 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Ccdc33Q3ULW6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms