Protein–RNA interactions for Protein: Q3UHE1

Pitpnm3, Membrane-associated phosphatidylinositol transfer protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 974 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitpnm3Q3UHE1 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Aqp5-201ENSMUST00000088200 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Lrp5-201ENSMUST00000025856 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mef2d-202ENSMUST00000107558 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Lzic-201ENSMUST00000030842 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Fam98b-201ENSMUST00000028825 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Bmp8a-202ENSMUST00000102641 1917 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tlk2-204ENSMUST00000106941 3699 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Picalm-206ENSMUST00000207484 8209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Pitpnm3Q3UHE1 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Hmgn2-204ENSMUST00000105893 973 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Foxq1-201ENSMUST00000042118 4843 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 A230083G16Rik-201ENSMUST00000069553 991 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Klhdc8b-210ENSMUST00000193895 2718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Actr3-202ENSMUST00000178474 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Slc35f2-201ENSMUST00000048670 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16475-201ENSMUST00000207306 512 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Lrfn1-202ENSMUST00000108288 3060 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Tfap4-201ENSMUST00000005862 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Amigo1-202ENSMUST00000106656 5482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Map4k5-201ENSMUST00000049239 4452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Pitpnm3Q3UHE1 Gm28265-201ENSMUST00000188201 2319 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.5 ms