Protein–RNA interactions for Protein: Q3UGY8

Arfgef3, Brefeldin A-inhibited guanine nucleotide-exchange protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 2,170 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfgef3Q3UGY8 Arl5b-206ENSMUST00000193836 481 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rnpc3-203ENSMUST00000106536 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mir5126-201ENSMUST00000175513 77 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm35558-201ENSMUST00000222675 2219 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Park7-203ENSMUST00000105674 937 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ifi27l2a-201ENSMUST00000055071 463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Pus1-204ENSMUST00000112426 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Grk6-202ENSMUST00000099482 2169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Bin2-204ENSMUST00000182775 1908 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rab40c-207ENSMUST00000167626 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ppp2r1b-209ENSMUST00000176349 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Otud7a-201ENSMUST00000058476 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Agfg1-205ENSMUST00000187899 2078 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cldn22-201ENSMUST00000038693 995 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Crlf3-201ENSMUST00000061283 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Coq10b-202ENSMUST00000087617 834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Fbxo36-201ENSMUST00000097672 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Negr1-201ENSMUST00000041425 2095 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.06
Arfgef3Q3UGY8 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 AC159093.1-201ENSMUST00000227779 380 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 4930431F12Rik-201ENSMUST00000079389 429 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Pparg-202ENSMUST00000171644 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Wnt6-201ENSMUST00000006716 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 1700001G17Rik-201ENSMUST00000191779 889 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Rpl13a-204ENSMUST00000209711 495 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Fkbp14-202ENSMUST00000117375 1830 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 4933434E20Rik-209ENSMUST00000162114 1411 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Grb14-201ENSMUST00000028252 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Zfp706-201ENSMUST00000078976 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Dpf3-205ENSMUST00000177801 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a43-201ENSMUST00000047655 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Hsdl1-201ENSMUST00000036049 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Slc25a3-206ENSMUST00000170810 1341 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arfgef3Q3UGY8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms