Protein–RNA interactions for Protein: Q3UFY0

Rrp36, Ribosomal RNA processing protein 36 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp36Q3UFY0 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Utp18-201ENSMUST00000066888 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Nrg3-201ENSMUST00000166968 4011 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Rgl1-202ENSMUST00000111857 3037 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Mrpl57-201ENSMUST00000022538 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Tsnax-201ENSMUST00000075896 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Wdr20-205ENSMUST00000193053 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 2700033N17Rik-201ENSMUST00000140185 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Specc1-215ENSMUST00000202744 674 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Cck-203ENSMUST00000215228 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Uqcc2-201ENSMUST00000025045 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Zfp783-201ENSMUST00000095946 670 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Impdh1-202ENSMUST00000159124 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Rrp9-201ENSMUST00000047721 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Lat2-202ENSMUST00000077636 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm20517-202ENSMUST00000132397 4807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 1700066B19Rik-201ENSMUST00000097617 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 E130307A14Rik-208ENSMUST00000145971 830 ntTSL 3 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Nfu1-201ENSMUST00000032060 948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Agbl5-208ENSMUST00000201168 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Inpp5e-202ENSMUST00000114090 2790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Nipsnap1-201ENSMUST00000038570 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Kcnj14-201ENSMUST00000071937 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.55■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Atp1a1-201ENSMUST00000036493 3679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Ptgis-201ENSMUST00000018113 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 9530018F02Rik-201ENSMUST00000219513 2599 ntBASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Zpr1-206ENSMUST00000156440 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm53-201ENSMUST00000129907 1172 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Erh-205ENSMUST00000218740 981 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Nptx2-201ENSMUST00000071782 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Srcin1-203ENSMUST00000107596 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Fcgrt-201ENSMUST00000003512 1770 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Atxn7l3-202ENSMUST00000107132 3706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Dtnbp1-208ENSMUST00000222805 1231 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 C430049E01Rik-201ENSMUST00000207913 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Nbea-201ENSMUST00000029374 10986 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Pigz-201ENSMUST00000052174 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Rhod-202ENSMUST00000117462 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Spef1-201ENSMUST00000028801 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Pigp-202ENSMUST00000113906 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Wnt10b-205ENSMUST00000226846 1204 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Was-201ENSMUST00000033505 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
Rrp36Q3UFY0 Atp6v0a1-203ENSMUST00000103110 2716 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Pigs-201ENSMUST00000048073 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Tor2a-201ENSMUST00000009707 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 2810410L24Rik-202ENSMUST00000155681 2615 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Prpf40b-212ENSMUST00000145482 3308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Rrp36Q3UFY0 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms