Protein–RNA interactions for Protein: Q3UDE2

Ttll12, Tubulin--tyrosine ligase-like protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 639 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll12Q3UDE2 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll12Q3UDE2 Smarcd2-201ENSMUST00000021052 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.85
Ttll12Q3UDE2 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.33■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Mpig6b-201ENSMUST00000097337 2252 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Pqlc3-201ENSMUST00000054536 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Bcl7b-203ENSMUST00000111188 1434 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Nptx1-201ENSMUST00000026670 5217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Tmem11-203ENSMUST00000168218 1511 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Mtmr1-202ENSMUST00000114601 4640 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Eps8-203ENSMUST00000111878 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Fjx1-201ENSMUST00000099678 3134 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Hmga1-204ENSMUST00000118570 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Papola-203ENSMUST00000163473 2544 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Nr1h3-204ENSMUST00000111356 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Mir770-201ENSMUST00000103252 94 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Src-203ENSMUST00000109529 2020 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Lrrc36-202ENSMUST00000109355 2411 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Acvr1-201ENSMUST00000056376 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm45141-201ENSMUST00000206502 1888 ntBASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Btn1a1-202ENSMUST00000110434 1077 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm19569-202ENSMUST00000184658 1305 ntTSL 2 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Ctbp2-201ENSMUST00000033269 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Il17rc-201ENSMUST00000058300 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Synm-205ENSMUST00000208815 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Hmces-202ENSMUST00000113606 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Wnt10b-202ENSMUST00000166022 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm44924-201ENSMUST00000138087 421 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Imp3-201ENSMUST00000034827 924 ntAPPRIS P1 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Hdhd5-201ENSMUST00000075303 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Ttll12Q3UDE2 Espn-203ENSMUST00000070018 1618 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.2 ms