Protein–RNA interactions for Protein: Q3UBG2

Pid1, PTB-containing, cubilin and LRP1-interacting protein, mousemouse

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pid1Q3UBG2 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm5901-201ENSMUST00000106805 1140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Mmp17-201ENSMUST00000031390 6422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Arhgap8-201ENSMUST00000006029 1527 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ddx41-204ENSMUST00000224765 2199 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Plekha7-210ENSMUST00000182834 5257 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm3764-202ENSMUST00000180582 440 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Fcrlb-201ENSMUST00000094337 1284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 9330151L19Rik-201ENSMUST00000181850 2545 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Rara-202ENSMUST00000107473 3238 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Arid3c-202ENSMUST00000150809 1327 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Dap-205ENSMUST00000186547 535 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Usp6nl-202ENSMUST00000114937 7484 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Adnp-202ENSMUST00000088001 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ddhd1-201ENSMUST00000051310 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Sfrp1-201ENSMUST00000033952 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Asic2-201ENSMUST00000021045 3436 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pid1Q3UBG2 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms