Protein–RNA interactions for Protein: Q3U827

Rnf180, E3 ubiquitin-protein ligase RNF180, mousemouse

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Length 592 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf180Q3U827 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gprc5c-201ENSMUST00000021071 2200 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Folr1-204ENSMUST00000106985 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Hsf4-203ENSMUST00000172525 1276 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Rab10os-206ENSMUST00000179908 746 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Cebpzos-202ENSMUST00000180077 602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 A430093F15Rik-205ENSMUST00000188480 509 ntTSL 3 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 2010107E04Rik-203ENSMUST00000222874 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm3667-201ENSMUST00000171906 2053 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Thap3-202ENSMUST00000105665 832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Chchd7-208ENSMUST00000121651 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm11424-201ENSMUST00000121929 829 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm14268-201ENSMUST00000132465 682 ntTSL 3 BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Mir7023-201ENSMUST00000185093 64 ntBASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Chchd7-201ENSMUST00000041122 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Rnf180Q3U827 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Stac2-201ENSMUST00000017544 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 CT010456.1-201ENSMUST00000222465 1688 ntTSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Prmt7-203ENSMUST00000109297 1094 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Siva1-202ENSMUST00000109755 333 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Vamp2-202ENSMUST00000117780 1113 ntTSL 2 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Ern1-202ENSMUST00000106799 660 ntTSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Zfp511-201ENSMUST00000168194 1076 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm37584-201ENSMUST00000193595 1290 ntBASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm30684-201ENSMUST00000205632 600 ntTSL 3 BASIC20.25■□□□□ 0.83
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Rnf180Q3U827 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Cdc123-201ENSMUST00000043864 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 1700029J07Rik-202ENSMUST00000098786 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Actl6a-201ENSMUST00000029214 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm12480-201ENSMUST00000129576 774 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Atp6v1g2-203ENSMUST00000130992 524 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 2410080I02Rik-201ENSMUST00000142712 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm29707-201ENSMUST00000196325 491 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Emg1-201ENSMUST00000004379 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Rncr4-201ENSMUST00000194541 2234 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Cpne2-202ENSMUST00000109537 2121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Pink1-201ENSMUST00000030536 2375 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Pcgf3-202ENSMUST00000112597 2169 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Rnf180Q3U827 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
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Rnf180Q3U827 4930448I06Rik-201ENSMUST00000194002 546 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 3110082I17Rik-201ENSMUST00000066052 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Fkbp9-201ENSMUST00000031795 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Dnase2a-202ENSMUST00000109744 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Suz12-201ENSMUST00000017692 4373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Arpc1b-211ENSMUST00000196111 1394 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Pofut1-203ENSMUST00000099192 1385 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 1700008O03Rik-201ENSMUST00000107933 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm7222-201ENSMUST00000117512 906 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Cdpf1-203ENSMUST00000134631 786 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gm16163-201ENSMUST00000161868 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Dusp13-202ENSMUST00000119866 1342 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Rnf180Q3U827 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
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