Protein–RNA interactions for Protein: Q3U487

Hectd3, E3 ubiquitin-protein ligase HECTD3, mousemouse

Predictions only

Length 861 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hectd3Q3U487 Zfp691-204ENSMUST00000179290 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Eml2-201ENSMUST00000048502 2275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Tsen2-203ENSMUST00000130425 638 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Gm42778-201ENSMUST00000199644 553 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Mapk8ip3-208ENSMUST00000121787 5431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Vgll3-201ENSMUST00000168064 7009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Clic1-201ENSMUST00000007257 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 C2cd2-201ENSMUST00000170757 6555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Hectd3Q3U487 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Letm1-203ENSMUST00000148451 2478 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Lrp8-201ENSMUST00000030356 4555 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Dao-201ENSMUST00000086599 1525 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Ina-201ENSMUST00000037636 3240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Chd4-202ENSMUST00000112390 6537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Dlgap1-201ENSMUST00000060072 5420 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Ola1-201ENSMUST00000028517 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 D16Ertd472e-203ENSMUST00000114220 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Phf1-201ENSMUST00000073724 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Golga7b-201ENSMUST00000087123 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Sh2b3-201ENSMUST00000040308 2530 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Npdc1-201ENSMUST00000055921 1412 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nespas-201ENSMUST00000143738 1083 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Ccdc85b-201ENSMUST00000179549 609 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Fdx1-201ENSMUST00000034552 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Mrpl12-201ENSMUST00000043627 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Fbxl12os-202ENSMUST00000136376 2349 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Camsap1-202ENSMUST00000114167 7981 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Camsap1-201ENSMUST00000091268 7978 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gdf15-202ENSMUST00000110103 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Spdef-205ENSMUST00000167489 1708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Heyl-201ENSMUST00000040821 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nadk2-203ENSMUST00000100790 3665 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Lhfp-203ENSMUST00000147139 1932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Hist1h2ag-201ENSMUST00000091741 485 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Fancg-201ENSMUST00000030165 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Paqr6-204ENSMUST00000147991 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nek2-201ENSMUST00000027931 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Camta1-202ENSMUST00000097774 8533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Phactr2-203ENSMUST00000105545 8556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 2700046G09Rik-201ENSMUST00000181612 1641 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Plpp6-201ENSMUST00000045674 2859 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Syt3-202ENSMUST00000118962 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Tsc22d4-205ENSMUST00000110985 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Ppp4r1l-ps-204ENSMUST00000140992 367 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm20421-201ENSMUST00000153344 672 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 AI480526-205ENSMUST00000160255 1095 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Gm26881-201ENSMUST00000180426 593 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Hectd3Q3U487 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.5 ms