Protein–RNA interactions for Protein: Q3U3Q1

Ulk3, Serine/threonine-protein kinase ULK3, mousemouse

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Length 472 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ulk3Q3U3Q1 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 5033430I15Rik-201ENSMUST00000038032 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ado-201ENSMUST00000075686 4445 ntAPPRIS P1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tmem80-201ENSMUST00000026578 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 1810010K12Rik-201ENSMUST00000070378 1324 ntBASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Hikeshi-206ENSMUST00000153470 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Wisp2-201ENSMUST00000029188 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Cyb5a-204ENSMUST00000160180 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.26
Ulk3Q3U3Q1 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Soga3-201ENSMUST00000092629 4105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rprm-201ENSMUST00000100089 1460 ntAPPRIS P1 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mms22l-202ENSMUST00000108222 4478 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mapk9-205ENSMUST00000109179 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mapk9-209ENSMUST00000164643 4682 ntTSL 5 BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rilpl2-201ENSMUST00000031347 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.64■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm16759-204ENSMUST00000191455 4272 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cask-201ENSMUST00000033321 4057 ntTSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Fam160b1-201ENSMUST00000036407 5630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.63■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rftn1-201ENSMUST00000044503 4029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Hmga1-205ENSMUST00000118599 529 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Wasf2-201ENSMUST00000084241 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm19531-201ENSMUST00000216737 1377 ntTSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Dio3-201ENSMUST00000097228 1449 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC16.62■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Bcor-204ENSMUST00000115513 6941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Snhg6-203ENSMUST00000182580 473 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Oxld1-201ENSMUST00000044007 813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Stxbp6-201ENSMUST00000053768 4553 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Pced1a-202ENSMUST00000110277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Lrig2-207ENSMUST00000199070 5991 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Bpifb4-203ENSMUST00000109759 2115 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Nudt17-204ENSMUST00000200387 2108 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Oxr1-206ENSMUST00000170127 4251 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Cep85l-205ENSMUST00000220443 7425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.61■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Ulk3Q3U3Q1 Zcchc4-203ENSMUST00000113904 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
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