Protein–RNA interactions for Protein: Q3TWW8

Srsf6, Serine/arginine-rich splicing factor 6, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srsf6Q3TWW8 Gm19553-201ENSMUST00000175723 494 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm43073-201ENSMUST00000198200 1189 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Naa30-205ENSMUST00000153488 4446 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Pknox2-201ENSMUST00000039674 3632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Sptbn4-207ENSMUST00000172269 8737 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Rbms1-209ENSMUST00000164147 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Spata33-204ENSMUST00000212346 715 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Nbn-201ENSMUST00000029879 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 5730507C01Rik-202ENSMUST00000177778 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gls-202ENSMUST00000114510 5596 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tex30-206ENSMUST00000133677 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Mpc1-205ENSMUST00000142594 961 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Lat-206ENSMUST00000206793 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tssc4-208ENSMUST00000208779 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Cbr2-201ENSMUST00000026148 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 1700037H04Rik-201ENSMUST00000028800 832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ube2f-201ENSMUST00000059743 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Tpbgl-201ENSMUST00000178124 3022 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Cebpa-201ENSMUST00000042985 2626 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ager-201ENSMUST00000015596 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm16272-201ENSMUST00000128218 388 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Myef2-209ENSMUST00000152367 2071 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Lrch2-201ENSMUST00000112819 4892 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Erlin1-202ENSMUST00000112028 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Mark2-206ENSMUST00000164205 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Sumf1-201ENSMUST00000032191 2593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Mcfd2-201ENSMUST00000024963 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Eapp-203ENSMUST00000160085 676 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Gm6296-201ENSMUST00000222599 943 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Nudt16l1-201ENSMUST00000050881 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Rbm43-201ENSMUST00000102767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Hrh3-201ENSMUST00000056480 2706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Scube1-202ENSMUST00000043634 5161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Fmnl2-204ENSMUST00000127122 5508 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Srsf6Q3TWW8 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms