Protein–RNA interactions for Protein: Q3TLS3

Gdpgp1, GDP-D-glucose phosphorylase 1, mousemouse

Predictions only

Length 386 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gdpgp1Q3TLS3 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Ptges2-201ENSMUST00000028162 4978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Foxk1-202ENSMUST00000198422 687 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 a-201ENSMUST00000029123 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Vax2-201ENSMUST00000037807 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Mtcl1-201ENSMUST00000086693 7221 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Igdcc4-205ENSMUST00000213533 6220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Igdcc4-201ENSMUST00000035499 6223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp277-202ENSMUST00000069692 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tfeb-204ENSMUST00000113288 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Agtr1a-201ENSMUST00000066412 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Shc3-201ENSMUST00000021898 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Efnb3-201ENSMUST00000004036 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Pabpn1-205ENSMUST00000141446 912 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Jsrp1-201ENSMUST00000020435 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Psmb5-201ENSMUST00000022803 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Fabp3-201ENSMUST00000070532 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp995-205ENSMUST00000190066 2221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 2300009A05Rik-201ENSMUST00000168665 595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Tspyl2-201ENSMUST00000044509 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Hps6-201ENSMUST00000099393 2696 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Trmt2a-202ENSMUST00000100099 2235 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Prdm12-201ENSMUST00000113470 2471 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Rccd1-202ENSMUST00000121882 2324 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Casd1-201ENSMUST00000015333 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Chrd-202ENSMUST00000115423 2417 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Znrf4-201ENSMUST00000052211 1236 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gdpgp1Q3TLS3 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Gm4425-201ENSMUST00000172838 2857 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Nkd1-203ENSMUST00000211113 1474 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Tbc1d19-201ENSMUST00000037337 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Krt90-201ENSMUST00000023714 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Sarm1-202ENSMUST00000108287 4868 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Phtf1-202ENSMUST00000063717 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 BC030336-201ENSMUST00000060175 4831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Pdlim5-202ENSMUST00000058626 873 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Chst5-201ENSMUST00000034430 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Prkar2b-202ENSMUST00000036497 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Rnpep-202ENSMUST00000077340 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 B3gnt6-201ENSMUST00000098278 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Adamts19-201ENSMUST00000052907 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 9530068E07Rik-201ENSMUST00000036952 2467 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gdpgp1Q3TLS3 Klhdc8b-201ENSMUST00000035232 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36 ms