Protein–RNA interactions for Protein: Q3TD49

Sppl2b, Signal peptide peptidase-like 2B, mousemouse

Predictions only

Length 578 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl2bQ3TD49 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 C030037D09Rik-202ENSMUST00000136201 1216 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Snrnp35-201ENSMUST00000031349 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Manbal-201ENSMUST00000081202 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 F8a-201ENSMUST00000105111 2505 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Hs6st1-201ENSMUST00000088174 3719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Myo1b-203ENSMUST00000114537 4618 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Ppt2-205ENSMUST00000169067 1392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 1810026B05Rik-205ENSMUST00000184855 409 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Cmtm7-202ENSMUST00000084867 874 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Pomgnt2-207ENSMUST00000217610 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Zfp78-205ENSMUST00000208030 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Dnaja4-202ENSMUST00000120452 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Rasl2-9-201ENSMUST00000147835 1013 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Def6-201ENSMUST00000002327 2277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Hspb6-201ENSMUST00000044048 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Tpm2-203ENSMUST00000107914 1164 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Acaa1a-203ENSMUST00000175743 1219 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Acaa1a-207ENSMUST00000176397 996 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Ptcra-201ENSMUST00000041012 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Sppl2bQ3TD49 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Ncam2-202ENSMUST00000067602 3563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 9130019P16Rik-201ENSMUST00000135612 1019 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Celrr-203ENSMUST00000185678 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Ahnak-201ENSMUST00000092955 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Elac2-201ENSMUST00000071891 2771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Mpv17l-205ENSMUST00000143697 580 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Smim1-210ENSMUST00000146054 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Sppl2bQ3TD49 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.3 ms