Protein–RNA interactions for Protein: Q3MI99

Ccbe1, Collagen and calcium-binding EGF domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 408 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccbe1Q3MI99 Mapk14-202ENSMUST00000062694 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Safb-207ENSMUST00000182533 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Pgm2-201ENSMUST00000058351 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Dmrt1-201ENSMUST00000025755 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tbc1d9-201ENSMUST00000034145 4631 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 H2-Q10-202ENSMUST00000174525 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 1700123O20Rik-201ENSMUST00000038539 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Mapk8ip1-201ENSMUST00000050312 2930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 4932422M17Rik-201ENSMUST00000195992 2639 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tap1-201ENSMUST00000041633 2614 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Col11a2-202ENSMUST00000114252 5620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Txndc15-201ENSMUST00000021959 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Senp7-211ENSMUST00000202000 3218 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gng5-203ENSMUST00000119130 593 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm4285-201ENSMUST00000131222 902 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Epb41l4aos-201ENSMUST00000146010 430 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Far2os2-201ENSMUST00000149815 980 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Serbp1-216ENSMUST00000205106 1288 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Rbp4-201ENSMUST00000025951 1243 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Eda-203ENSMUST00000113776 5105 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tcf3-209ENSMUST00000105345 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm10209-201ENSMUST00000203397 1607 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm45470-202ENSMUST00000210817 2192 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Emilin3-202ENSMUST00000109454 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm17484-201ENSMUST00000167899 2322 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm2011-201ENSMUST00000203124 1263 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tbx18-201ENSMUST00000034991 4679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ubfd1-201ENSMUST00000033158 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Lrp12-202ENSMUST00000110305 4244 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ltbp4-202ENSMUST00000108369 5377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 4930412F12Rik-201ENSMUST00000211700 1471 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Mef2d-201ENSMUST00000001455 5401 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Smarcd3-208ENSMUST00000195943 1712 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Smarcd3-201ENSMUST00000030791 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm12356-201ENSMUST00000122854 353 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm18284-201ENSMUST00000172604 624 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 4930535I16Rik-201ENSMUST00000181410 519 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Tor3a-208ENSMUST00000190607 453 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Kiss1-204ENSMUST00000194044 583 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Mrpl2-201ENSMUST00000002844 1031 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Ccbe1Q3MI99 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Tuba1b-201ENSMUST00000077577 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Tfap2a-206ENSMUST00000224665 1958 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm26889-201ENSMUST00000181523 2252 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm45212-201ENSMUST00000205831 3403 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 1700086O06Rik-202ENSMUST00000181871 1564 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Eif5a-209ENSMUST00000108612 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Paip2-204ENSMUST00000115736 857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Sumo2-205ENSMUST00000121185 911 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm11713-201ENSMUST00000139941 523 ntTSL 3 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Spata33-201ENSMUST00000060133 491 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Gm6139-201ENSMUST00000079261 882 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Ccbe1Q3MI99 Nr2c2ap-201ENSMUST00000095273 1161 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.6 ms