Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLL3

Cpne9, Copine-9, mousemouse

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Length 553 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne9Q1RLL3 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm28914-201ENSMUST00000188115 667 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Mtmr3-202ENSMUST00000109943 5674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Lrch4-201ENSMUST00000031734 3078 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Enpp1-202ENSMUST00000105520 6777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Donson-201ENSMUST00000023682 2360 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Dkk4-201ENSMUST00000033936 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Arpc1a-201ENSMUST00000031625 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 D330023K18Rik-201ENSMUST00000133550 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Axin1-203ENSMUST00000163421 2890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Il4i1-202ENSMUST00000118125 2275 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Arid1a-205ENSMUST00000145664 8187 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Cpne9Q1RLL3 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Myh7b-201ENSMUST00000092995 6163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Bhlhb9-201ENSMUST00000068755 2823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Ntng1-204ENSMUST00000106571 1446 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Ntng1-210ENSMUST00000138953 1443 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Adrb3-202ENSMUST00000117565 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gapvd1-203ENSMUST00000113099 5758 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 P2rx5-201ENSMUST00000006104 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Ptpre-207ENSMUST00000211140 5753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Mrpl13-205ENSMUST00000172387 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Cpne9Q1RLL3 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
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