Protein–RNA interactions for Protein: Q1RLK6

B3gnt4, N-acetyllactosaminide beta-1,3-N-acetylglucosaminyltransferase 4, mousemouse

Predictions only

Length 350 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
B3gnt4Q1RLK6 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.28
B3gnt4Q1RLK6 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Hoxa1-202ENSMUST00000120363 2043 ntTSL 1 (best) BASIC16.77■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Gatad2a-202ENSMUST00000116463 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Mdfi-203ENSMUST00000113280 1281 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Gm26709-203ENSMUST00000223260 715 ntTSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Mrps6-201ENSMUST00000047429 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Tial1-201ENSMUST00000033135 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Klhl2-201ENSMUST00000034017 3412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Dbnl-203ENSMUST00000109845 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Dach1-202ENSMUST00000071533 5219 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Phldb3-204ENSMUST00000206422 2564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Sdc3-201ENSMUST00000070478 4973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Nt5c1a-201ENSMUST00000068262 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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B3gnt4Q1RLK6 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Actrt3-201ENSMUST00000047630 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
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B3gnt4Q1RLK6 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Nck2-201ENSMUST00000086421 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Fst-202ENSMUST00000223640 2612 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Ache-202ENSMUST00000085934 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
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B3gnt4Q1RLK6 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Ptprf-201ENSMUST00000049074 7656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Gm11373-201ENSMUST00000129791 2819 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Ssfa2-203ENSMUST00000111788 4976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Ak6-201ENSMUST00000022135 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Znrf1-205ENSMUST00000172856 4600 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Igf2-202ENSMUST00000097936 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Fam129b-201ENSMUST00000028135 3714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
B3gnt4Q1RLK6 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.6 ms