Protein–RNA interactions for Protein: Q14BI7

Tdrd9, ATP-dependent RNA helicase TDRD9, mousemouse

Predictions only

Length 1,383 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd9Q14BI7 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Slc47a2-201ENSMUST00000093029 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Upp1-205ENSMUST00000164791 1252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Tob1-201ENSMUST00000041589 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Pih1d1-202ENSMUST00000107811 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Dars-202ENSMUST00000064309 645 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Gm15645-201ENSMUST00000131504 2208 ntTSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Laptm4b-201ENSMUST00000022867 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Pomgnt2-201ENSMUST00000084743 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Dtx3-202ENSMUST00000116229 1994 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tdrd9Q14BI7 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Creb3l1-201ENSMUST00000028663 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 4931422A03Rik-201ENSMUST00000056170 1037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Sec61b-201ENSMUST00000065678 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm6190-201ENSMUST00000220683 1374 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Mamstr-201ENSMUST00000148532 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Lrrc43-201ENSMUST00000094327 2046 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Nrn1l-202ENSMUST00000118920 603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm20675-201ENSMUST00000175861 338 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm5867-201ENSMUST00000063197 592 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Chtop-204ENSMUST00000107342 2411 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Rtkn-203ENSMUST00000121093 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Ppil3-202ENSMUST00000114345 1175 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Sh3bp1-202ENSMUST00000061239 1917 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Kl-201ENSMUST00000078856 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Arhgef1-204ENSMUST00000117796 3508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Derl3-202ENSMUST00000217811 1316 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm10052-201ENSMUST00000168019 960 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm37280-201ENSMUST00000194583 375 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm7729-201ENSMUST00000050143 801 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Vps72-201ENSMUST00000009102 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Gm7935-201ENSMUST00000100555 1278 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tdrd9Q14BI7 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 Abhd8-201ENSMUST00000008094 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 Rilpl1-201ENSMUST00000062153 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 Gm19345-201ENSMUST00000172815 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Tdrd9Q14BI7 AC148328.1-201ENSMUST00000216448 920 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82 ms