Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE82

Cpne7, Copine-7, mousemouse

Predictions only

Length 557 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cpne7Q0VE82 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 4930503L19Rik-201ENSMUST00000067556 2291 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Kcns1-201ENSMUST00000045196 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Smarcc1-207ENSMUST00000199896 5773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Fam109a-201ENSMUST00000056654 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ubp1-201ENSMUST00000009885 3742 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Glmn-201ENSMUST00000078021 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Grk2-202ENSMUST00000088737 3376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Sos1-201ENSMUST00000068714 8919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Schip1-201ENSMUST00000029346 2201 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Sfrp4-201ENSMUST00000002883 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Tfeb-203ENSMUST00000113284 1974 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm42939-201ENSMUST00000197514 2205 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 9330111N05Rik-202ENSMUST00000181043 2449 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Mfsd13a-201ENSMUST00000086969 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Bcl11b-203ENSMUST00000109891 2888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Znhit1-203ENSMUST00000111090 698 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gls2-201ENSMUST00000044776 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Camkk2-211ENSMUST00000200109 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm15545-202ENSMUST00000141011 899 ntTSL 3 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Il17a-201ENSMUST00000027061 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Fzd5-202ENSMUST00000116133 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Tmem136-202ENSMUST00000213544 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Cdh4-201ENSMUST00000000314 6388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.46
Cpne7Q0VE82 Slc30a9-204ENSMUST00000162372 5711 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Cpne7Q0VE82 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.3 ms