Protein–RNA interactions for Protein: Q0VE29

Samd12, Sterile alpha motif domain-containing protein 12, mousemouse

Predictions only

Length 161 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd12Q0VE29 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Appbp2os-202ENSMUST00000206972 447 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 AC122379.1-201ENSMUST00000220658 355 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tra2a-201ENSMUST00000031841 1799 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ivns1abp-203ENSMUST00000111887 2783 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tjp3-201ENSMUST00000045744 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Pqlc1-202ENSMUST00000091798 1989 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ube3c-201ENSMUST00000049453 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rce1-201ENSMUST00000025823 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cachd1-202ENSMUST00000097955 4277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Dnajc25-201ENSMUST00000095070 4023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rnf103-202ENSMUST00000114178 3431 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Trpv4-203ENSMUST00000112219 2295 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ube2d3-208ENSMUST00000197134 2493 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Mcub-201ENSMUST00000029624 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ppp2r2a-204ENSMUST00000225380 1988 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rbm47-203ENSMUST00000113724 2186 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Pip4k2a-201ENSMUST00000006912 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Polr3gl-204ENSMUST00000145001 607 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Wdr41-208ENSMUST00000222995 1112 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cog8-201ENSMUST00000034391 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gpx4-201ENSMUST00000097227 995 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Zmynd11-207ENSMUST00000110638 4003 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Sh2d4a-201ENSMUST00000066594 2718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Hs3st2-201ENSMUST00000084628 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Dlx1-201ENSMUST00000037119 4111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Kcnq2-205ENSMUST00000103048 2827 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Synpo-206ENSMUST00000130360 5159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Atxn7l2-203ENSMUST00000117784 2387 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tmem145-202ENSMUST00000119703 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Xrcc1-205ENSMUST00000205573 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rcc1-203ENSMUST00000105951 2326 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Pskh1-201ENSMUST00000049699 3255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rerg-202ENSMUST00000117919 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rps6kb2-201ENSMUST00000025749 1864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Stx4a-201ENSMUST00000033075 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Lrfn1-201ENSMUST00000055110 1479 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Nisch-208ENSMUST00000165981 2415 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Aldh5a1-201ENSMUST00000037615 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Adgrd2-ps-201ENSMUST00000118797 2662 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Bnip2-202ENSMUST00000085393 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 St8sia5-201ENSMUST00000075290 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Papd4-201ENSMUST00000048702 2990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Rab10-201ENSMUST00000021001 3513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Polr3d-201ENSMUST00000000793 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Ppard-201ENSMUST00000002320 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Sorcs3-201ENSMUST00000078880 5634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Atp8b2-201ENSMUST00000069805 5559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Wdr12-202ENSMUST00000117438 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Dcdc2c-206ENSMUST00000221349 2209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 AK157302-201ENSMUST00000104942 1924 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Baz1a-205ENSMUST00000173433 5788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Samd12Q0VE29 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.4 ms