Protein–RNA interactions for Protein: Q0VB07

Pglyrp4, Peptidoglycan recognition protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pglyrp4Q0VB07 Gm26507-201ENSMUST00000181838 1410 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Sh2b2-204ENSMUST00000196447 1783 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Susd1-202ENSMUST00000107544 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gm21168-201ENSMUST00000199646 1096 ntBASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gm10153-201ENSMUST00000084415 522 ntTSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gm10306-201ENSMUST00000094969 533 ntAPPRIS P1 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tspan17-202ENSMUST00000099503 822 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gcgr-201ENSMUST00000026119 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Jph4-201ENSMUST00000022819 4489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Vegfc-201ENSMUST00000033919 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Rgs19-202ENSMUST00000108769 1460 ntTSL 2 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Col4a1-201ENSMUST00000033898 6615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tcp1-201ENSMUST00000089024 1902 ntTSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Ano8-204ENSMUST00000213382 3785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.88□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Lrrc32-203ENSMUST00000205956 4576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Naa50-204ENSMUST00000161326 4487 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tmem229b-206ENSMUST00000174697 3697 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Cdo1-201ENSMUST00000035804 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Cant1-205ENSMUST00000106289 1600 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Nipsnap2-205ENSMUST00000186265 1600 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Hoxb8-201ENSMUST00000052650 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Pwwp2a-201ENSMUST00000061070 3277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Lhpp-202ENSMUST00000106170 999 ntTSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gm44238-201ENSMUST00000203300 353 ntTSL 3 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Lmo1-201ENSMUST00000036992 1282 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Vamp5-201ENSMUST00000074231 553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Eif2ak3-201ENSMUST00000034093 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Lrrc27-202ENSMUST00000106104 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Prkab2-201ENSMUST00000045743 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tpr-201ENSMUST00000119161 7480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Cdh24-201ENSMUST00000067784 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.87□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Fbxo47-201ENSMUST00000093939 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Klhl25-203ENSMUST00000205612 1343 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Trim41-201ENSMUST00000047145 3432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Sphk1-201ENSMUST00000063396 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Smpd1-201ENSMUST00000046983 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Ppp1r12b-203ENSMUST00000112163 828 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Msantd1-203ENSMUST00000202205 744 ntTSL 2 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gm45121-201ENSMUST00000205396 1153 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Avp-201ENSMUST00000046001 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 1700012B09Rik-201ENSMUST00000060330 688 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Lhx2-203ENSMUST00000143783 1696 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Porcn-202ENSMUST00000082320 1883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Nectin2-202ENSMUST00000108450 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Vsig10-201ENSMUST00000086464 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Wdr41-203ENSMUST00000160115 2851 ntTSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Spsb3-203ENSMUST00000117890 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.86□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Wdr1-201ENSMUST00000005234 3089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Mpc1-208ENSMUST00000155364 958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tmem147-201ENSMUST00000006478 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tsks-201ENSMUST00000080233 1806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Gnas-208ENSMUST00000109087 1716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.85□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Elfn2-201ENSMUST00000088592 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Ralgapb-203ENSMUST00000109486 8383 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 App-201ENSMUST00000005406 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Psen2-202ENSMUST00000111104 1475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Itm2c-203ENSMUST00000185569 1465 ntTSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Apc-202ENSMUST00000079362 8867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Elmo2-204ENSMUST00000103088 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC11.84□□□□□ -0.51
Pglyrp4Q0VB07 Ppm1m-203ENSMUST00000140761 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.84□□□□□ -0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.6 ms