Protein–RNA interactions for Protein: Q06986

Siah2, E3 ubiquitin-protein ligase SIAH2, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Siah2Q06986 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cdkl3-203ENSMUST00000109076 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 4932443I19Rik-204ENSMUST00000214337 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 A330009N23Rik-201ENSMUST00000180639 1392 ntTSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rbl2-201ENSMUST00000034091 4925 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Aup1-201ENSMUST00000092618 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.17□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Espn-204ENSMUST00000080042 1402 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 1700003E16Rik-202ENSMUST00000203203 2070 ntTSL 2 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rraga-201ENSMUST00000091064 1618 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ube2d2a-201ENSMUST00000167406 2393 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ppp1r3g-203ENSMUST00000225537 2389 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tmem39b-201ENSMUST00000102588 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tnnt2-202ENSMUST00000112085 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tnnt2-203ENSMUST00000112086 1094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tnnt2-204ENSMUST00000112087 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tnnt2-206ENSMUST00000178854 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tnnt2-211ENSMUST00000189355 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tnnt2-212ENSMUST00000189732 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Psmd6-201ENSMUST00000022256 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gabra4-205ENSMUST00000199357 2407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rbmxl1-201ENSMUST00000049245 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gfra3-201ENSMUST00000025224 1992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Hbs1l-202ENSMUST00000061324 1998 ntTSL 3 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Zmym3-206ENSMUST00000120107 5882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Vegfa-201ENSMUST00000024747 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.16□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ndufv1-202ENSMUST00000128787 1436 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ndufv1-207ENSMUST00000134479 1438 ntTSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Aamp-201ENSMUST00000006462 1817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Zfp1-201ENSMUST00000077791 1811 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Zfp710-201ENSMUST00000049680 4721 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Slc16a7-205ENSMUST00000210780 2562 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Arntl-201ENSMUST00000047321 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Dgkz-201ENSMUST00000028667 3584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 0610040J01Rik-201ENSMUST00000081747 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 4930432B10Rik-202ENSMUST00000181330 1612 ntTSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.15□□□□□ -0.14
Siah2Q06986 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Mboat7-201ENSMUST00000038608 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Chmp6-201ENSMUST00000026434 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 2210408F21Rik-204ENSMUST00000136571 478 ntTSL 3 BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Fau-203ENSMUST00000179142 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Mpp3-203ENSMUST00000107167 2066 ntTSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Mapk7-201ENSMUST00000079080 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Gm43213-201ENSMUST00000151866 1790 ntBASIC14.14□□□□□ -0.15
Siah2Q06986 Eif4a1-213ENSMUST00000163666 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.14□□□□□ -0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms