Protein–RNA interactions for Protein: Q06348

Prrx2, Paired mesoderm homeobox protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 247 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrx2Q06348 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.05
Prrx2Q06348 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Fgf23-201ENSMUST00000000186 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gorasp2-202ENSMUST00000112201 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cdca4-201ENSMUST00000062092 2425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Slc35f4-202ENSMUST00000123534 2748 ntTSL 1 (best) BASIC14.71□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 AC121961.1-201ENSMUST00000218594 1779 ntBASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Usf2-201ENSMUST00000058860 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Zfp324-204ENSMUST00000210619 447 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cd37-204ENSMUST00000209779 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Tmem196-201ENSMUST00000058644 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Neo1-201ENSMUST00000068664 7379 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.7□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Lgmn-201ENSMUST00000021607 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 E2f1-202ENSMUST00000103145 2732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm28876-201ENSMUST00000188137 703 ntTSL 3 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm43347-201ENSMUST00000200226 580 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Dgcr6-202ENSMUST00000076757 894 ntTSL 5 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Nkx2-3-201ENSMUST00000057178 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cwh43-202ENSMUST00000065543 2316 ntTSL 1 (best) BASIC14.69□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 4833445I07Rik-201ENSMUST00000193193 1642 ntBASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm15889-201ENSMUST00000159142 1083 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Timm13-204ENSMUST00000219896 542 ntTSL 3 BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Tlcd1-202ENSMUST00000098545 2897 ntTSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Pknox1-203ENSMUST00000175806 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 F2rl3-201ENSMUST00000058099 1751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.68□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Ankrd17-202ENSMUST00000081914 8057 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Tal1-204ENSMUST00000162489 2894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Map3k5-201ENSMUST00000095806 5450 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Klc1-204ENSMUST00000122300 2268 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm26871-202ENSMUST00000180774 695 ntTSL 2 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm26756-201ENSMUST00000181689 1294 ntTSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm29791-202ENSMUST00000207888 369 ntBASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Olfr572-203ENSMUST00000215782 1233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Tmem123-201ENSMUST00000052865 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cdk5r2-201ENSMUST00000160379 2799 ntAPPRIS P1 BASIC14.67□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Inip-202ENSMUST00000107526 1438 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Lamp1-201ENSMUST00000033824 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Cpne2-201ENSMUST00000048653 2342 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Enah-203ENSMUST00000111025 3385 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Atf1-201ENSMUST00000023769 2365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Mkln1os-202ENSMUST00000144232 964 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
Prrx2Q06348 Idh1-201ENSMUST00000097709 2302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
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