Protein–RNA interactions for Protein: Q05A80

Caprin2, Caprin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,031 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Caprin2Q05A80 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Fam213a-202ENSMUST00000118466 1567 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Nes-203ENSMUST00000160694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 B3gnt9-202ENSMUST00000136822 2516 ntAPPRIS P1 BASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm6598-201ENSMUST00000202719 2615 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Gm5898-201ENSMUST00000121016 2071 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Fev-202ENSMUST00000159232 928 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Rab7-206ENSMUST00000203674 424 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Cyp4f14-202ENSMUST00000179434 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Cyp4f14-201ENSMUST00000054174 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Eif4enif1-203ENSMUST00000110049 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Caprin2Q05A80 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Cnn2-201ENSMUST00000004784 2460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Cep57-208ENSMUST00000147115 2262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Plppr3-207ENSMUST00000167250 3063 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gm26858-201ENSMUST00000180608 2040 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Hapln2-201ENSMUST00000005014 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Aqp2-201ENSMUST00000023752 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Rpl36al-202ENSMUST00000110619 1276 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Speg-203ENSMUST00000113588 1078 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 C430014B12Rik-202ENSMUST00000186858 657 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Acbd4-203ENSMUST00000107040 1959 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Camk2b-202ENSMUST00000019133 2223 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Prtg-201ENSMUST00000055535 9148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ror1-201ENSMUST00000039630 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Fem1b-201ENSMUST00000034775 6785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Lypla1-208ENSMUST00000150971 877 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ppp2r1b-205ENSMUST00000175640 1523 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Arid4b-204ENSMUST00000110536 5783 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Mterf1a-202ENSMUST00000117463 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 K230015D01Rik-201ENSMUST00000211969 1516 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Pdgfa-201ENSMUST00000046901 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 AC121598.2-201ENSMUST00000228376 2325 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ppp4r3a-201ENSMUST00000048305 4516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ssfa2-201ENSMUST00000111784 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Fam57a-201ENSMUST00000094014 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Megf11-210ENSMUST00000164113 6018 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 1810041L15Rik-203ENSMUST00000189248 5296 ntTSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Parg-201ENSMUST00000022470 4413 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Rps23-201ENSMUST00000051955 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Caprin2Q05A80 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.73■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.1 ms