Protein–RNA interactions for Protein: Q05186

Rcn1, Reticulocalbin-1, mousemouse

Predictions only

Length 325 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rcn1Q05186 Agxt-201ENSMUST00000027491 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Tspan10-201ENSMUST00000044105 1680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Apoa5-202ENSMUST00000121598 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Specc1-210ENSMUST00000201723 2690 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Phf7-201ENSMUST00000022459 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Hyi-205ENSMUST00000194248 936 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Tor1b-201ENSMUST00000028199 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Pcsk5-202ENSMUST00000050715 5783 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm18336-201ENSMUST00000180787 2298 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Bend5-201ENSMUST00000030274 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Eif4h-201ENSMUST00000036125 2367 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Kri1-205ENSMUST00000184326 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Sh3glb1-202ENSMUST00000198254 5945 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Dach1-201ENSMUST00000069334 5063 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Scrt1-202ENSMUST00000164703 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm40848-201ENSMUST00000221998 324 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gpx7-201ENSMUST00000030332 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Cmc4-201ENSMUST00000033543 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Cisd1-201ENSMUST00000045887 1084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Itpripl2-201ENSMUST00000178344 6865 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Arrb2-205ENSMUST00000108568 1777 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Aldh7a1-206ENSMUST00000172734 1880 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm36858-201ENSMUST00000194501 2391 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Gm9867-201ENSMUST00000192212 2647 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Igdcc3-203ENSMUST00000217371 3183 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Ttc39b-202ENSMUST00000048274 1804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Rcn1Q05186 Rab7-202ENSMUST00000113596 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Espnl-201ENSMUST00000088904 5445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Srpr-201ENSMUST00000034541 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Pde8b-201ENSMUST00000022192 2517 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Hsd3b2-201ENSMUST00000107021 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Eva1a-201ENSMUST00000042974 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Slc8a3-202ENSMUST00000085238 4927 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Seh1l-201ENSMUST00000025421 3516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Tmem260-201ENSMUST00000111735 5485 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ogfr-201ENSMUST00000029087 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Nr2e1-201ENSMUST00000019938 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Chn1-203ENSMUST00000112024 4050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Chn1-210ENSMUST00000180045 4050 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Slc39a7-201ENSMUST00000025186 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gabpb1-203ENSMUST00000103226 1338 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Dars-201ENSMUST00000027602 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gon7-202ENSMUST00000179263 525 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Gramd4-204ENSMUST00000138134 4292 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Usp27x-201ENSMUST00000115744 3240 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Letm2-208ENSMUST00000210616 2974 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Itsn1-203ENSMUST00000095909 6103 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Fscn1-207ENSMUST00000198017 2157 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Adnp2-201ENSMUST00000066743 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Grtp1-207ENSMUST00000211128 1416 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Kcna6-204ENSMUST00000185333 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Dsg2-202ENSMUST00000120102 3590 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Ctf1-201ENSMUST00000047393 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Olfr533-202ENSMUST00000211093 2397 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Rcn1Q05186 Slc15a3-201ENSMUST00000025646 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms