Protein–RNA interactions for Protein: Q04744

Emx2, Homeobox protein EMX2, mousemouse

Predictions only

Length 253 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Emx2Q04744 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Sart3-201ENSMUST00000019118 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gtpbp3-208ENSMUST00000168847 2803 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Man2a2-201ENSMUST00000098346 6554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Tmem14c-201ENSMUST00000021790 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Smpdl3a-201ENSMUST00000020022 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Homez-202ENSMUST00000142283 4713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Nt5dc3-201ENSMUST00000099396 5952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gbe1-201ENSMUST00000023393 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Dhx30-224ENSMUST00000200066 4623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Mtcp1-201ENSMUST00000033542 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Lsm1-201ENSMUST00000038421 2663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Prcd-201ENSMUST00000106381 724 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Ypel1-202ENSMUST00000090199 631 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Eva1c-202ENSMUST00000099543 1554 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Hmga1-202ENSMUST00000117254 1328 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Mrps23-203ENSMUST00000118784 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Col11a2-203ENSMUST00000114255 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Tomm6-201ENSMUST00000113301 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Emx2Q04744 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Gm18025-201ENSMUST00000221733 862 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Ltb-201ENSMUST00000025262 1160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Tmem192-201ENSMUST00000026595 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Gm10065-201ENSMUST00000076238 345 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Zbtb45-201ENSMUST00000051390 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Plppr5-202ENSMUST00000106473 4294 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Slc25a31-201ENSMUST00000091184 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Emx2Q04744 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms