Protein–RNA interactions for Protein: Q04683

Cxcr5, C-X-C chemokine receptor type 5, mousemouse

Predictions only

Length 374 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cxcr5Q04683 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Tmem131l-201ENSMUST00000052342 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Unc13b-201ENSMUST00000079978 6354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Elk4-202ENSMUST00000086556 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
Cxcr5Q04683 Csrp2-201ENSMUST00000020403 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Knstrn-202ENSMUST00000110842 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Pts-208ENSMUST00000215416 439 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gtf2h2-201ENSMUST00000066940 1065 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm9970-201ENSMUST00000068997 558 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Htatip2-202ENSMUST00000207895 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gsto2-201ENSMUST00000056159 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Prex1-201ENSMUST00000036719 6533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Smim27-201ENSMUST00000129758 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Wasl-202ENSMUST00000041737 1298 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm4968-201ENSMUST00000071458 858 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 4430402I18Rik-205ENSMUST00000162110 1559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Taz-208ENSMUST00000132437 768 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm2559-201ENSMUST00000201323 363 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm44672-201ENSMUST00000206944 1098 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Ubxn1-201ENSMUST00000096255 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Unc13b-203ENSMUST00000107953 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 AI314180-201ENSMUST00000055822 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm27405-201ENSMUST00000184201 112 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm8495-201ENSMUST00000188740 694 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Tbc1d7-201ENSMUST00000021797 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Olfr322-201ENSMUST00000072030 984 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 BC107364-201ENSMUST00000093126 1159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 BC107364-202ENSMUST00000098841 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gdpd5-201ENSMUST00000037528 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Col17a1-201ENSMUST00000026045 5588 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Abcb10-201ENSMUST00000075578 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Shroom3-201ENSMUST00000113051 6435 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Mief1-203ENSMUST00000228788 5352 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Cxcr5Q04683 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms