Protein–RNA interactions for Protein: Q03717

Kcnb1, Potassium voltage-gated channel subfamily B member 1, mousemouse

Predictions only

Length 857 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnb1Q03717 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Zswim8-208ENSMUST00000224751 5951 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Cnksr1-201ENSMUST00000030645 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Krt81-201ENSMUST00000061185 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ykt6-201ENSMUST00000002818 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Rragd-201ENSMUST00000029946 5055 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Igflr1-202ENSMUST00000172251 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Smim22-201ENSMUST00000178155 429 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Pdzd8-201ENSMUST00000099274 7076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Smim1-212ENSMUST00000146543 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Mdfi-202ENSMUST00000066368 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Sncaip-205ENSMUST00000178011 3433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Gm27029-201ENSMUST00000107257 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Fbxo22-201ENSMUST00000034859 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Gm26774-201ENSMUST00000181534 2401 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Aprt-204ENSMUST00000212093 723 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Crb3-202ENSMUST00000097299 1206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Tfdp2-206ENSMUST00000185644 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Relb-201ENSMUST00000049912 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Icam2-201ENSMUST00000001055 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Creb1-207ENSMUST00000187811 1255 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Tspan5-201ENSMUST00000029800 6653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Rusc2-202ENSMUST00000098106 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Zfp467-209ENSMUST00000114566 543 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Atp23-202ENSMUST00000168520 1043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Unc13a-208ENSMUST00000177517 5654 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Prodh-201ENSMUST00000003620 2385 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Nfix-204ENSMUST00000109764 5476 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Sec61a1-201ENSMUST00000032168 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Stambp-206ENSMUST00000206400 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Kcnb1Q03717 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms