Protein–RNA interactions for Protein: Q03517

Scg2, Secretogranin-2, mousemouse

Predictions only

Length 617 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Scg2Q03517 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm15582-201ENSMUST00000132849 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Senp2-201ENSMUST00000023561 4499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Cdc34-202ENSMUST00000166603 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm18958-201ENSMUST00000174258 762 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Agbl5-215ENSMUST00000202060 3121 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Mast4-205ENSMUST00000166726 5968 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Rimklb-201ENSMUST00000068242 4725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Hcn2-202ENSMUST00000099513 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gmcl1-202ENSMUST00000113679 960 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Mir1668-201ENSMUST00000184114 107 ntBASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Lce1h-201ENSMUST00000051521 706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm7008-201ENSMUST00000038121 1366 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ccdc149-201ENSMUST00000059428 3295 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm7213-201ENSMUST00000215977 950 ntBASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Etv5-201ENSMUST00000079601 3975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Srf-201ENSMUST00000015749 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Trim54-201ENSMUST00000013771 1434 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gtf3a-204ENSMUST00000146511 1298 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Fam149b-216ENSMUST00000225942 2151 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Wdr74-202ENSMUST00000210512 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
Scg2Q03517 Scaf8-201ENSMUST00000076734 4869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Sap18-203ENSMUST00000111269 459 ntTSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Cldn18-203ENSMUST00000131922 860 ntTSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Pcyox1-206ENSMUST00000204116 546 ntTSL 5 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Scg2Q03517 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.7 ms